Какое право (собст. или долгоср. аренды) имеет влияние на расчет?
Влияет ли вышеизложенное право (то и то) на расчет?
Каким образом?

Сейчас выйдет в онлайн составитель справочников и будет предлагать посмотреть в его справочниках коэфф.)))

1).Опять здесь НЕАДЭКВАТНЫЙ "говорун", от которого ВЕЗДЕ НА ФОРУМЕ НИКАКОГО ТОЛКУ ПО ЧАСТИ ПРАКТИЧЕСКИХ ПОЗНАНИЙ, поскольку он НЕ ОЦЕНЩИК, а генеральный директор с экономическим и юридическим образованием, но полный профан в оценке недвижиомости
2). Итак, РЕКАПИТАЛИЗАЦИЯ
Стоимость (рыночная) = Денежный поток / Ккапитализации
Первый ответ: получаем рыночную стоимость (а не стоимость прав долгосрочной/краткосрочной аренды).
Денежный поток = Стоимость * Ккапитализации
Денежный поток = Ставка аренды - Платежи за землю
Здесь Платежи за землю ОБЫЧНО представлены налогом на собственника земли.
Ставка аренды = Стоимость * Ккапитализации + Платежи за землю
Справочно: Ккапитализации ОЧЕНЬ СЛОЖНО ОПРЕДЕЛЯЕТСЯ в данном случае (он варьируется в диапазоне 1,5% ... 16% в зависимости от многих параметров...)
ДЕРЗАЙТЕ

при этом начальные права на участок - право долгосрочной аренды..

права на участок - право долгосрочной аренды, участок в аренде у Автодора. Теперь автодор должен сдать в субаренду и говорит о том, чтобы при расчете рыночной стоимости прав на участок учитывалось право собственности, для дальнейшего расчета арендной ставки.
Объект оценки поняла правильно
Право влияет (ответила ранее), так как от стоимости этого права рассчитывается дальнейшая аренда
Разница между стоимостью прав долгосрочной аренды и собственности имеется

Вам правильно сделали замечание, арендную ставку нужно считать для объекта земельный участок на праве собственности, а не для права аренды ЗУ, если новый арендатор, то есть субарендатор, получает в пользование земельный участок со всеми вытекающими правами, как и первоначальный, в свою очередь первоначальный арендатор с его правами аренды "отходит в сторону", то есть не пользуется и не мешает пользоваться ЗУ новому арендатору, становится только "прокладкой" для передачи платежей от субарендатора собственнику.
Если оба арендатора продолжают пользоваться одной территорией (условно одними и теми же кв.м.) совместно на каких-то оговоренных условиях, то тогда все зависит от режима пользования, то есть у оцениваемого ЗУ будет некое обременение, которое Вы учтете в расчете, но это маловероятно и участники форума об этом Вам точно не смогут что-то подсказать.
В остальном Евгений Евстафьевич дал исчерпывающий алгоритм. По обоснованию ставки капитализации проблемы есть всегда, тут ничего не поделаешь, этот параметр очень ценен и необходим, но часто трудно добываем )

теоретически я понимаю, о чем замечание..но в общем случае у правообладателя, с правом долгосрочной аренды, нет права распоряжения участком (которое дает право собственности), поэтому его стоимость ниже.. пользование будет одновременно, это публичный сервитут на 11 мес...

1).Опять здесь НЕАДЭКВАТНЫЙ "говорун", от которого ВЕЗДЕ НА ФОРУМЕ НИКАКОГО ТОЛКУ ПО ЧАСТИ ПРАКТИЧЕСКИХ ПОЗНАНИЙ, поскольку он НЕ ОЦЕНЩИК, а генеральный директор с экономическим и юридическим образованием, но полный профан в оценке недвижиомости

Замечание сделано абсолютно корректно!
от того , что арендатор сдает в субаренду, а не собственник в аренду - ставка не должна меняться. она рассчитывается исходя из стоимости права собственности.